近日，中國科學院武漢病毒研究所石正麗與崔杰課題組在我國云南省發(fā)現了一處蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒的天然基因庫，揭示了 SARS 冠狀病毒可能的重組起源。

蝙蝠是 SARS 樣冠狀病毒的自然儲存宿主。自2005年以來，多個研究團隊在我國及歐洲地區(qū)的多種菊頭蝠中發(fā)現了越來越多的 SARS 樣冠狀病毒。但是，大部分蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒的刺突蛋白基因和部分附屬基因與 SARS 冠狀病毒差異明顯。目前已報道的蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒至少在兩個基因上與 SARS 冠狀病毒存在較大分化。因此，它們都不是造成2002-2003年疫情的 SARS 冠狀病毒的直接祖先。雖然目前已有充分證據表明蝙蝠是 SARS 病毒的源頭，但有關 SARS 如何在蝙蝠中進化產生、從哪里的蝙蝠種群中出現等問題還未得到解答。 

武漢病毒所石正麗與崔杰課題組自2011年起對云南省一處洞穴的菊頭蝠種群開展了為期5年的 SARS 樣冠狀病毒的長期監(jiān)測，共進行10次樣品采集，在64份蝙蝠糞便粒和肛拭子樣品中檢測到 SARS 樣冠狀病毒 RNA。對這些 SARS 樣冠狀病毒 S 基因受體結合區(qū)的擴增與分析結果顯示，流行于這一洞穴的蝙蝠SARS樣冠狀病毒高度多樣，可分為兩大簇，其中一簇在 RBD 區(qū)更接近 SARS 病毒，不存在大部分 SARS 樣冠狀病毒所出現的缺失。課題組對11株新發(fā)現的 SARS 樣冠狀病毒進行了全長基因組擴增，并對15株在該洞穴發(fā)現的毒株（含4株前期已報道的毒株）進行了全基因組序列分析。

結果表明，流行于該洞穴的蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒在非結構蛋白基因 ORF1ab 上彼此相近，然而它們的 S 基因和 ORF8 基因卻呈現極為豐富的遺傳多樣性。重要的是，在 S 基因的 N 端區(qū)域、RBD 區(qū)、ORF3、ORF8 等4個基因組高變區(qū)上分別與 SARS 病毒高度同源的 SARS 樣冠狀病毒均存在于該洞穴的蝙蝠中。也就是說，SARS 冠狀病毒的全部基因組組分都可以在這個 SARS 樣冠狀病毒的天然基因庫中找到。通過進一步重組分析，課題組在這些 SARS 樣冠狀病毒 S 基因內部和 ORF8 附近等多個位點發(fā)現了頻繁重組的證據，并推測 SARS 冠狀病毒的直接祖先可能通過這些蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒的祖先株之間發(fā)生的一系列的重組事件而產生。 

此外，該研究通過反向遺傳學方法，將新發(fā)現毒株的S基因替換到已構建的WIV1株SARS樣冠狀病毒全長感染性克隆上，并對三株新發(fā)現的S基因不同的SARS樣冠狀病毒的跨種傳播能力進行了評估。結果顯示，S基因不存在缺失的多株SARS樣冠狀病毒均可在Vero E6細胞中有效復制，并可使用與SARS病毒相同的受體——人ACE2入侵HeLa細胞。除S基因以外，課題組對新發(fā)現的蝙蝠SARS樣冠狀病毒中遺傳多樣的ORF8也進行了初步的功能研究，發(fā)現不同基因型的ORF8均具有和SARS病毒ORF8相類似的活化轉錄激活因子6（ATF6）的功能；而首次發(fā)現的具有和晚期SARS冠狀病毒類似的ORF8a/8b的蝙蝠SARS樣冠狀病毒Rs4084株，其ORF8a也表現出誘導細胞凋亡的功能。 

該研究為認識SARS冠狀病毒的起源與進化提供了新的見解，揭示了我國蝙蝠攜帶有不同株具有跨種傳播至人群可能性的SARS樣冠狀病毒，并為相關疾病的預防提供了重要依據。 

相關研究成果在線發(fā)表于病原學期刊 PLoS Pathogens 上。文章在線發(fā)表后，被 PLoS Pathogens 列為本周推薦文章。12月1日，Nature news 對此進行了報道，指出該發(fā)現回答了關于 SARS 病毒起源遺留的問題，援引香港大學微生物學家袁國勇的評論：“這項發(fā)現告誡我們需減少對蝙蝠等野生動物棲息地的侵擾、杜絕野生動物市場交易，這對于防止新發(fā)傳染病的發(fā)生至關重要”。

（看看新聞Knews記者：張幗霞 實習編輯：蔡悅揚）