3月31日，日本厚生勞動省及和歌山縣相關(guān)部門，對小林制藥公司位于和歌山縣紀(jì)之川市的工廠進(jìn)行現(xiàn)場檢查。檢查結(jié)束后，小林制藥公司制造本部長山下健司，在接受現(xiàn)場媒體采訪時鞠躬道歉。山下稱，公司現(xiàn)在的的責(zé)任是向公眾準(zhǔn)確傳達(dá)目前的狀況和相關(guān)數(shù)據(jù)。對于媒體關(guān)于現(xiàn)場檢查的內(nèi)容以及工廠紅曲原料保存情況的提問，山下稱目前正在接受檢查，無法作出回答。

據(jù)悉小林制藥位于大阪市的一家老廠去年12月關(guān)閉后，和歌山縣的這家工廠接管原料制造業(yè)務(wù)。依據(jù)和歌山縣政府說法，這家工廠接手了大阪工廠的生產(chǎn)設(shè)備，并從今年1月開始生產(chǎn)原料。據(jù)日本廣播協(xié)會報道，厚生勞動省和地方政府派出的17人工作小組進(jìn)入該工廠檢查，來自大阪工廠的設(shè)備也在檢查之列。此前一天（30日），厚生勞動省與大阪市官員一起檢查了大阪那家工廠，而山下健司也現(xiàn)身媒體面前鞠躬致歉。

日本多家媒體報道，大阪工廠去年4月至10月生產(chǎn)的紅曲原料經(jīng)檢測查出軟毛青霉酸。軟毛青霉酸是由青霉菌產(chǎn)生的一種天然化合物。依據(jù)厚生勞動省說法，這種物質(zhì)可能存在毒性，但尚不清楚是否會傷害腎臟。

截至3月29日，服用該公司涉事保健品的消費者中已有5人死亡、114人住院。小林制藥公司分析相關(guān)保健品及其使用的紅曲原料后發(fā)現(xiàn)，其自產(chǎn)紅曲原料中存在當(dāng)初“意想不到”、來自霉菌的成分，尚未弄清該成分究竟是什么。多名微生物學(xué)家懷疑，生產(chǎn)過程中的衛(wèi)生問題可能導(dǎo)致紅曲產(chǎn)品被本不應(yīng)出現(xiàn)的青霉菌污染。